Ghislain Bardout a grandi dans les Alpes. À l’adolescence il découvre la plongée dans les lacs qu’il pratique en parallèle des sports de montagne. À 20 ans, il organise son premier projet d’expédition (non réalisé) visant à aller explorer, en plongée, les fonds d’un lac d’altitude gelé.
Après le baccalauréat, il étudie à l’école Polytechnique de Lausanne, où il est diplômé en ingénierie mécanique. Il effectue à cette époque un stage au centre océanographique de Monaco. Parallèlement durant l’été il est bénévole au Centre International de Plongée des Glénan (CIP Glénan) où il devient moniteur fédéral de plongée niveau 2.
En 2006, il travaille pour Jean Louis Etienne sur le projet Total Pole Airship. Il organise à cette occasion une première plongée au Pôle Nord qui va lui inspirer la série d’expéditions Under The Pole.